木材运输管理是依法确保长时间的木材运输秩序，避免非法砍伐的木材转入流通流域的最重要措施。《中华人民共和国森林法实行条例》规定，从林区运往非国家统一拨给的木材，必需持有人县级以上人民政府林业主管部门核准的木材运输证。
重点林区的木材运输证，由国务院林业主管部门核准其他木材运输证，由县级以上地方人民政府林业主管部门核准。对于没木材运输证运输木材的，由县级以上人民政府林业主管部门充公非法运输的木材，对货主可以处以非法运输木材价款以下的罚款。
《中华人民共和国森林法实行条例》第三十六条规定，对于申请人木材运输证，应该递交下列证明文件： 林木砍伐许可证或者其他合法来源证明 检疫证明 省、自治区、直辖市人民政府林业主管部门规定的其他文件。
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